《新世纪福音战士》系列第二部剧场版，于 1997 年 7 月 19 日在日本上映。全名：《新世纪福音战士剧场版：THE END OF EVANGELION》（日语：新世紀エヴァンゲリオン 劇場版 THE END OF EVANGELION - Air/まごころを、君に，英语：NEON GENESSI EVANGELION: END OF EVANGELION - AIR/SINCERELY YOURS）。剧情承接 TV 动画版第 24 集，包括了重新制作的第 25 、第 26 话。在这部剧场版中第 25 话的名字是 “AIR”（天空），而副标题是 “LOEV IS DESTRUCTIVE”（爱是一种伤害）；第 26 话的名字是 “YOUR SINCERELY”（真心为你），副标题是“ONE MORE FINAL: I NEED YOU”（再说最后一遍：我需要你）。剧场版的每一话都和电视版一样有一个 “EYE - CATCH” 镜头（即每集中间那个黑底白字的英文标题）。这部剧场版标志着整个旧世纪《新世纪福音战士》的终结。影片分成 “Air” 与 “真心为你” 两个部分。神秘的 EVA 零号机驾驶员绫波丽，在与碇元渡约定之时，来到了 NERV 底层中央教条的红色水池边。她的命运似乎就将在此结束。在危急时刻，葛城美里不但要完成加持良治交待的对“第二次浩劫”真相以及“人类补完计划”的探查工作，还要保护碇真嗣与明日香，以及防备 SEELE 对初号机与二号机的物理接触。出于对碇元渡的憎恨，赤木律子接受了 SEELE 引爆 MAGI 的提案，她能否成功 ？长期与 SEELE 共事的碇元度、冬月耕造、碇唯，为了防止人类“最终的悲剧”，而酝酿了的“人类补完计划”能否实现 ？尽在《新世纪福音战士》电影版第 2 部中解答。